Afortunadamente, se ha mantenido la transmisión manual de 6 velocidades de serie, pero ahora en su lugar se puede elegir la «automática» hidromecánica de 8 velocidades Gazoo Racing Direct, que es capaz de anticiparse a las acciones del conductor y «colarle» la marcha más adecuada en cada momento gracias al programa de control inteligente. La nueva transmisión automática ha sido probada por los pilotos del TGR World Rally Team y se dice que es muy robusta y fiable, con la temperatura controlada por su propio radiador de refrigeración. El modo manual de la transmisión automática se realiza de la misma forma que en los coches de carreras: para subir de marcha, hay que tirar de la palanca hacia uno, y para bajar, hay que empujar la palanca alejándola del conductor.
El sistema de tracción total es el mismo: la potencia se transmite a las ruedas traseras mediante un embrague multidisco precargado, con un diferencial autoblocante Torsen en cada eje. En Japón, se ofrece como opción para el GR Yaris una palanca de freno de mano vertical desplazada hacia delante, más cerca del volante. Aún no se han anunciado las características dinámicas del utilitario actualizado. Peso en vacío de la versión con «manual» – 1280 kg, con «automático» – 1300 kg.
La carrocería del GR Yaris con techo de fibra de carbono se ha vuelto más rígida debido a que el número de puntos de soldadura se ha incrementado en un 13%, la cantidad de pegamento estructural ha aumentado en un 24% (aquí y más allá hay una comparación con el GR Yaris de serie pre-restyling, no con la edición limitada GRMN Yaris para el mercado japonés, que también tenía una carrocería reforzada). El nuevo parachoques delantero tiene conductos de aire diferentes, más numerosos, y rejillas laterales para la disipación del calor de los radiadores adicionales.
